SERVICIO GENERAL DE PROTEÓMICA
Equipamiento
La Unidad de Proteómica de la UPV/EHU dispone de un espectrómetro de masas Waters Micromass Q-Tof micro dotado con un sistema NanoLockSpray y conectado a un HPLC Waters CapLC XE System y de la plataforma informática MassLynx.
Las características del equipo son:
- Fuente ZSprayTM-dual orthogonal.
- Resolución 5000 FWHM.
- Exactitud de masa por debajo de 5ppm tanto en modo MS como MS/MS.
- Analizador oa-Tof (orthogonal-time of flight) con rango de adquisición hasta 20000 m/z.
- Data Directed Analisis (DDATM): detección de compuestos de interés y cambio automático de MS a MS/MS.
- Precursor ion discovery: técnicas de adquisición clase-específicas (i.e. detección de motivos estructurales específicos) mediante detección por neutral loss o product ion.
- Cromatografía de flujo variable para una mayor calidad de análisis en MS/MS.
La Unidad de Proteómica de la UPV/EHU dispone de los siguientes motores de búsqueda:
- ProteinLynx Global Server (Waters)
- MASCOT (Matrix Science )
- PHENYX (GenBio)
- PEAKS (Bioinformatics Solutions )
- VEMS (Rune Matthiesen )