La excavación de Zornoztegi tiene como objetivo principal excavar en extensión el primer despoblado en Álava para conocer aspectos básicos de la vida cotidiana de un pueblo de hace más de mil años.
Las investigaciones previas realizadas por la Universidad del País Vasco en Álava han mostrado que fue en la Alta Edad Media cuando se ha gestado el paisaje y la estructura básica del poblamiento que ha llegado hasta la actualidad. Tras la caída del Imperio Romano y la desarticulación de sus espacios, fue en torno al siglo VIII-IX cuando han surgido la mayor parte de las aldeas, los pueblos y los asentamientos que aún hoy se encuentran en Álava. De hecho, las raíces del paisaje tradicional alavés han de buscarse en estos siglos.
Sin embargo, muchos de estos pueblos han sido transformados durante la propia Edad Media (Vitoria, Salvatierra, Alegria, etc.) o en época reciente, por lo que no resulta posible conocer las primeras fases fundacionales de estos poblados.
Por este motivo, el estudio de un despoblado como el de Zornoztegi permite reconocer cómo se vivía en la Edad Media, cómo han surgido estos pueblos y cómo se ha modificado. De hecho a través de esta investigación es posible saber cómo era Agurain, Dulantzi y otras muchas aldeas que se encontraban en Álava.

Para alcanzar estos objetivos se ha diseñado un proyecto trienal (2006-2008) en colaboración con otras instituciones científicas, como la Univeristy College of London.

  Pero además de llevar a cabo una investigación, el proyecto tiene como fin formar a estudiantes de arqueología de la Universidad del País Vasco y llevar a cabo toda una serie de iniciativas de carácter cultural y social en colaboración con el Ayuntamiento de Salvatierra Agurain y la Cuadrilla de Agurain.