Contienen azufre. Son C y M. La cisteína (C) tiene gran importancia estructural en las proteínas porque puede reaccionar con el grupo SH de otra C para formar un puente disulfuro (-S-S-), permitiendo el plegamiento de la proteína. Por este motivo, en algunos hidrolizados proteicos se obtiene el AA cistina, que está formado por dos cisteínas unidas por un puente disulfuro.

Cisteína, Cys, C	Metionina, Met, M
Polar, sin carga. Forma puentes disulfuro. pKa = 8,5.	Apolar. Es el primer aminoácido en la síntesis de proteínas